تبني قضية الاسرى ورعايتهم والدفاع عنهم يشكل التزاما وطنيا ، وقانونيا ،وانسانيا، واخلاقيا ينسجم مع الحقوق المشروعة للشعب الفلسطيني والاتفاقيات والقرارات الدولية .عدالة قضية الأسرى القابعين في سجون الاحتلال الاسرائيلي تنبع من عدالة القضية الفلسطينية والحقوق المشروعة التي يناضلون من اجلها .العمل على تحرير الاسرى والمعتقلين من سجون الاحتلال الاسرائيلي والذي يعتبر جزء من حق تقرير المصير للشعب الفلسطيني وتحقيق اهدافه المشروعة بالحرية والاستقلال والعودة واقامة دولته المستقلة وعاصمتها القدس .ترسيخ مشروعية نضال الاسرى تنبع من كونهم أسرى حركة تحرر وطني تنطبق عليهم الاتفاقيات والمعاهدات الدولية ذات الصلة .الضغط على المجتمع الدولي للقيام بدوره والتزاماته من اجل مواجهة الانتهاكات والخروقات الاسرائيلية لحقوق الاسرى وفق قواعد واحكام القانون الدولي ورفع المعاناة عنهم والعمل على اطلاق سراحهم .نشر الوعي حول قضية الاسرى كمناضلي حرية يحترمون حقوق الانسان ويستحقون التمتع بها .تأهيل الاسرى بعد تحررهم لأخذ دورهم كقوة مجتمعية منتجة ومبدعة قادرة على المساهمة في بناء مجتمع حر ديموقراطي ..
هدف الهيئة إلى إيلاء قضية الأسرى والمعتقلين الاهتمام اللائق باعتبارها قضية مركزية للشعب والقيادة الفلسطينية بأبعادها الوطنية والقانونية والانسانية